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已发表论文

基于生物信息学与实验验证探索多囊卵巢综合征细胞黏附相关生物标志物

 

Authors Zhu J , Qi X, Zhang Z, Zhou Q, Gu R, Wu X, Zhong L

Received 4 December 2024

Accepted for publication 13 March 2025

Published 29 March 2025 Volume 2025:18 Pages 1777—1794

DOI http://doi.org/10.2147/IJGM.S509651

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Editor who approved publication: Dr Woon-Man Kung

摘要:

目的:既往研究表明细胞黏附机制在多囊卵巢综合征(PCOS)治疗中具有重要作用。本研究旨在筛选与PCOS治疗相关的细胞黏附相关基因(CRGs)生物标志物,并解析其生物学机制。
病例与方法:基于GSE80432数据集进行差异表达分析筛选PCOS组与对照组差异表达基因(DEGs),与1531CRGs取交集取得关键基因。采用支持向量机递归特征消除法联合最小绝对收缩选择算子筛选候选基因,将两个数据集中AUC值>0.7且表达趋势一致的基因定义为生物标志物。最终构建列线图预测模型,并召开富集分析、调控网络构建、药物预测、生物标志物与PCOS相关性验证及逆转录定量PCR(RT-qPCR)实验验证。
结果:共筛选出10个关键基因,从中鉴定出2个生物标志物(DSG2THBS1)。RT-qPCR显示PCOS样本中THBS1表达显著上调(P0.05),而DSG2未见显著差异。富集分析表明DSG2THBS1均富集于B细胞受体信号通路。构建了lncRNA-miRNA-mRNA调控网络(81个节点/135条边)和转录因子-生物标志物互作网络(38个节点/38条边),典型调控关系包括MIR17HG-hsa-miR-7-5p-THBS1、TFDP1-DSG2等。药物预测显示61种药物靶向DSG2,133种药物靶向THBS1。相关性分析证实THBS1PCOS关联性更强(推断评分=27.15)。
结论:本研究鉴定出2个生物标志物(DSG2THBS1),为多囊卵巢综合征(PCOS)的治疗给予了潜在的理论基础。

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